（一）重点实验室日常运行管理
1、重点实验室管理实行主任负责制
重点实验室实行学术委员会指导下的主任负责制。学术委员会由国内外相关领域著名专家组成，负责制定重点实验室的研究方向和开放课题的审批。重点实验室按照湖北省重点实验室管理的有关规定，积极贯彻“开放、流动、联合、竞争”的运行管理方针，为石油行业领域的专家学者及工程技术人员提供学术交流和试验环境。重点实验室将在运行管理与开放合作机制方面积极探索，通过边建设、边研究、边开放的方式，凝聚一批高水平的专家与学者，取得若干重要的成果，培养一批高素质的博、硕研究生。
重点实验室设主任1名，副主任3名。重点实验室主任根据省科技厅对重点实验室主任的条件和要求，公开进行招聘。重点实验室主任和副主任每届任期为五年。
重点实验室主任负责组织学术年会，研究、发布实验室开放课题指南，负责客座研究人员的管理，运行经费的使用管理，设备的更新、引进，以及协调各研究方向的合作，负责重点实验室用房调配，为科研以及办公提供良好的环境。
重点实验室另设主任助理1名，协助主任处理学术方面的日常管理工作。
2、积极探索重点实验室管理模式的创新
重点实验室成立“综合实验平台”建设总体组，负责综合实验平台的规划设计，审查各研究方向的研究计划，协调各个研究方向的研发进度等。为落实综合实验平台的建设目标，总体组每月定时召开一次例会，对各研究方向的工作进展进行检查，实施过程监控。
重点实验室按研究方向设置相应研究室，各研究室实行首席教授负责制。首席教授把握研究方向的研究内容，负责制定实施方案并组织实施。重点实验室采用两级模式进行管理，各研究室的人员聘任与考核由首席教授负责。
3、建立和落实重点实验室的各项规章制度
重点实验室直接依托于长江大学，是一个具有相对独立的人事权和财务权的科研实体。重点实验室需建立相对完善的规章制度，对人、财、物、教学、科研及服务等进行全面管理。重点实验室设专职秘书1名，协助行政主任完成重点实验室的日常行政管理、会议组织、文件档案管理、仪器设备管理等。
4、构建和谐进取的重点实验室文化
一个重点实验室的兴旺与发展与其是否具有良好的文化氛围有着密切的关系，在保证各项规章制度落实的前提下，重点实验室注重人性化的管理，提倡团结进取，合作共享的团队精神，通过学术研讨、合作攻关以及各种文体活动吸引人，培养人。
（二）人员聘用及流动
重点实验室拥有相对独立的人事权，实行聘任制。聘任研究方向首席教授、专职助理和若干名专职研究人员等组成重点实验室固定人员。
重点实验室将注意稳定一支高水平的技术队伍，注重引进高级人才，向国内外招聘杰出专家，充实各研究方向或新创相关研究领域。
建立相应的聘用人员岗位业绩考核制度，考核结果与科研津贴挂钩，连续两次考核不合格者，重点实验室将名单上交学校作为流动待聘人员处理。“竞争与合作”相结合的考核制度将有利于保持重点实验室人员的先进性与活力。
（三）仪器设备管理与使用
实验仪器的管理与维护是重点实验室的基础工作，重点实验室负责行政工作的副主任负责对仪器设备的日常管理，技术人员负责设备的维护。对于所有10万元以上的设备均分配到专人管理，负责设备的保养以及对使用人的培训等。每个大型设备均有独立的设备档案，记录设备的状态以及使用情况。重点实验室制定有“湖北省油气钻采工程重点实验室仪器设备管理办法”，以保证设备的完好、共享和对外开放。
（四）重点实验室的开放合作设想
1、与国内的其它石油院校合作
充分发挥长江大学石油工程专业在石油行业领域的优势，通过多种手段加强与各个石油高校的合作，建立合作团队，实现资源共享与整合。
2、与国内有关单位合作
为保证重点实验室在国内的先进性，加强与国内油田单位、有关研究院所和实验室的合作研究和交流，包括合作研究、成果、资料与资源共享等。重点实验室欢迎国内学者自带课题入室研究。重点实验室应与国内各大油田单位紧密合作，积极向企业提供科研以及技术与决策支持服务，为促进我国石油开采事业贡献了力量。
3、国际交流与合作
重点实验室将开展广泛的国际合作与交流，以吸引国外学者来重点实验室进行交流学习，同时鼓励重点实验室的研究人员和博士、硕士研究生出国进修和学习，建立科研人员“请进来，走出去”的交流模式。
4、开放课题资助
重点实验室实行开放流动的运行机制。开放课题分成定向公布及自由申请两类，第一类为重点实验室当前的攻关方向，在开放课题指南中明确规定；第二类为自由申请课题，主要鼓励研究人员在与重点实验室研究内容相关方向自由探索、创新。除开放课题外，重点实验室还积极探索仪器设备、尤其是“综合实验平台”的对外开放，利用设备优势吸引国内外相关领域的优秀学者自带课题到重点实验室从事研究工作，或以重点实验室资助仪器使用费的方式，进行合作研究，促进学术思想和研究项目的交流。